Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA10P31260 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms