Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRMP28827 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
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