Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PTPRBP23467 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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