Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLDCP23378 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLDCP23378 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GLDCP23378 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLDCP23378 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLDCP23378 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLDCP23378 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLDCP23378 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLDCP23378 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLDCP23378 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLDCP23378 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLDCP23378 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms