Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms