Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA6P23229 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms