Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPAP23025 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPAP23025 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPAP23025 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPAP23025 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPAP23025 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XPAP23025 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XPAP23025 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XPAP23025 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XPAP23025 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPAP23025 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPAP23025 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPAP23025 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPAP23025 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPAP23025 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPAP23025 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPAP23025 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPAP23025 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPAP23025 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPAP23025 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms