Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms