Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGAM1P18669 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms