Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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