Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB8P17481 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms