Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA1P17302 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA1P17302 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA1P17302 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA1P17302 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA1P17302 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA1P17302 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA1P17302 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA1P17302 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA1P17302 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA1P17302 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA1P17302 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA1P17302 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA1P17302 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA1P17302 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA1P17302 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA1P17302 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA1P17302 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA1P17302 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA1P17302 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA1P17302 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA1P17302 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA1P17302 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA1P17302 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms