Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGA1P17096 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA1P17096 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms