Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms