Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSPT1P15170 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GSPT1P15170 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms