Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRF1P14222 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRF1P14222 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRF1P14222 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRF1P14222 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRF1P14222 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRF1P14222 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms