Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms