Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD8P13378 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms