Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XRCC5P13010 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC5P13010 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms