Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms