Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEFHP12036 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEFHP12036 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEFHP12036 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEFHP12036 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEFHP12036 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NEFHP12036 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEFHP12036 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEFHP12036 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEFHP12036 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEFHP12036 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEFHP12036 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEFHP12036 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEFHP12036 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEFHP12036 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEFHP12036 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEFHP12036 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEFHP12036 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEFHP12036 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEFHP12036 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms