Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP10827 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP10827 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP10827 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP10827 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP10827 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP10827 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP10827 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP10827 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP10827 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP10827 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP10827 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP10827 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP10827 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP10827 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP10827 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP10827 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP10827 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP10827 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THRAP10827 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THRAP10827 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
THRAP10827 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
THRAP10827 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THRAP10827 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRAP10827 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THRAP10827 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
THRAP10827 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
THRAP10827 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THRAP10827 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms