Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAA2P0DJI9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAA2P0DJI9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SAA2P0DJI9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAA2P0DJI9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms