Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms