Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR29P0C7W0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR29P0C7W0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms