Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLK3P07288 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLK3P07288 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLK3P07288 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLK3P07288 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLK3P07288 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLK3P07288 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLK3P07288 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLK3P07288 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLK3P07288 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLK3P07288 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLK3P07288 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLK3P07288 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLK3P07288 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLK3P07288 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLK3P07288 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLK3P07288 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLK3P07288 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLK3P07288 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLK3P07288 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLK3P07288 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLK3P07288 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLK3P07288 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLK3P07288 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms