Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRBV12-3P01733 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV12-3P01733 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms