Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EGFRP00533 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EGFRP00533 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EGFRP00533 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EGFRP00533 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EGFRP00533 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EGFRP00533 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EGFRP00533 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EGFRP00533 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EGFRP00533 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EGFRP00533 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EGFRP00533 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EGFRP00533 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
EGFRP00533 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EGFRP00533 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EGFRP00533 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EGFRP00533 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EGFRP00533 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EGFRP00533 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EGFRP00533 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EGFRP00533 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EGFRP00533 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EGFRP00533 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EGFRP00533 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EGFRP00533 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EGFRP00533 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EGFRP00533 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EGFRP00533 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EGFRP00533 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EGFRP00533 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EGFRP00533 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EGFRP00533 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EGFRP00533 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EGFRP00533 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EGFRP00533 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EGFRP00533 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EGFRP00533 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EGFRP00533 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EGFRP00533 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EGFRP00533 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EGFRP00533 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EGFRP00533 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EGFRP00533 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EGFRP00533 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EGFRP00533 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EGFRP00533 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EGFRP00533 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EGFRP00533 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EGFRP00533 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EGFRP00533 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EGFRP00533 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EGFRP00533 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EGFRP00533 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EGFRP00533 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EGFRP00533 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EGFRP00533 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EGFRP00533 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EGFRP00533 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EGFRP00533 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EGFRP00533 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EGFRP00533 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EGFRP00533 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EGFRP00533 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EGFRP00533 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EGFRP00533 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EGFRP00533 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EGFRP00533 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EGFRP00533 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EGFRP00533 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EGFRP00533 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EGFRP00533 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EGFRP00533 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms