Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
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