Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYF2O95926 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYF2O95926 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYF2O95926 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYF2O95926 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYF2O95926 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYF2O95926 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYF2O95926 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYF2O95926 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYF2O95926 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYF2O95926 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYF2O95926 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYF2O95926 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYF2O95926 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYF2O95926 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYF2O95926 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYF2O95926 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYF2O95926 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYF2O95926 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYF2O95926 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYF2O95926 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYF2O95926 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYF2O95926 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYF2O95926 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYF2O95926 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYF2O95926 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYF2O95926 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYF2O95926 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYF2O95926 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYF2O95926 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYF2O95926 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYF2O95926 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYF2O95926 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYF2O95926 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYF2O95926 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYF2O95926 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYF2O95926 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYF2O95926 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms