Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX6O95503 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX6O95503 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX6O95503 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CBX6O95503 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX6O95503 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX6O95503 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX6O95503 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX6O95503 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX6O95503 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX6O95503 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX6O95503 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX6O95503 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX6O95503 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX6O95503 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX6O95503 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX6O95503 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX6O95503 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX6O95503 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms