Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFASCO94856 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFASCO94856 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFASCO94856 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFASCO94856 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFASCO94856 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFASCO94856 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFASCO94856 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFASCO94856 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFASCO94856 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFASCO94856 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFASCO94856 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFASCO94856 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFASCO94856 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFASCO94856 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFASCO94856 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFASCO94856 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFASCO94856 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFASCO94856 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFASCO94856 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFASCO94856 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NFASCO94856 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFASCO94856 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFASCO94856 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFASCO94856 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFASCO94856 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFASCO94856 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFASCO94856 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFASCO94856 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms