Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLIT2O94813 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLIT2O94813 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms