Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEBLO76041 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEBLO76041 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEBLO76041 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEBLO76041 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEBLO76041 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEBLO76041 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms