Protein–RNA interactions for Protein: O75976

CPD, Carboxypeptidase D, humanhuman

Predictions only

Length 1,380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPDO75976 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPDO75976 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPDO75976 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPDO75976 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPDO75976 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPDO75976 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPDO75976 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPDO75976 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPDO75976 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPDO75976 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPDO75976 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPDO75976 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPDO75976 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPDO75976 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPDO75976 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPDO75976 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPDO75976 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPDO75976 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPDO75976 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPDO75976 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPDO75976 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CPDO75976 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPDO75976 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPDO75976 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPDO75976 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPDO75976 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPDO75976 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPDO75976 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPDO75976 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPDO75976 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPDO75976 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPDO75976 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPDO75976 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPDO75976 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPDO75976 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPDO75976 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPDO75976 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPDO75976 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CPDO75976 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPDO75976 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPDO75976 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPDO75976 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPDO75976 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CPDO75976 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPDO75976 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPDO75976 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPDO75976 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CPDO75976 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPDO75976 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPDO75976 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPDO75976 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPDO75976 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPDO75976 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPDO75976 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPDO75976 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPDO75976 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPDO75976 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPDO75976 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPDO75976 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPDO75976 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPDO75976 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPDO75976 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPDO75976 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPDO75976 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPDO75976 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPDO75976 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CPDO75976 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPDO75976 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPDO75976 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPDO75976 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPDO75976 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPDO75976 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPDO75976 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms