Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms