Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN11O75508 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms