Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2F6O75461 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F6O75461 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F6O75461 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F6O75461 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F6O75461 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F6O75461 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F6O75461 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F6O75461 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F6O75461 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F6O75461 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F6O75461 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms