Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
VAMP4O75379 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VAMP4O75379 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VAMP4O75379 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VAMP4O75379 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VAMP4O75379 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VAMP4O75379 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VAMP4O75379 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VAMP4O75379 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
VAMP4O75379 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VAMP4O75379 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VAMP4O75379 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VAMP4O75379 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VAMP4O75379 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VAMP4O75379 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VAMP4O75379 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VAMP4O75379 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAMP4O75379 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAMP4O75379 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VAMP4O75379 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAMP4O75379 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAMP4O75379 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAMP4O75379 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VAMP4O75379 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VAMP4O75379 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VAMP4O75379 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VAMP4O75379 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VAMP4O75379 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
VAMP4O75379 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VAMP4O75379 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VAMP4O75379 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.54■■■□□ 2
VAMP4O75379 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms