Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms