Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms