Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRD4O60885 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRD4O60885 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRD4O60885 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRD4O60885 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRD4O60885 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRD4O60885 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRD4O60885 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRD4O60885 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRD4O60885 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRD4O60885 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
BRD4O60885 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRD4O60885 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRD4O60885 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRD4O60885 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRD4O60885 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRD4O60885 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRD4O60885 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRD4O60885 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRD4O60885 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRD4O60885 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRD4O60885 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRD4O60885 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRD4O60885 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRD4O60885 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRD4O60885 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD4O60885 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD4O60885 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD4O60885 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD4O60885 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD4O60885 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD4O60885 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD4O60885 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD4O60885 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRD4O60885 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRD4O60885 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRD4O60885 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRD4O60885 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
BRD4O60885 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRD4O60885 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRD4O60885 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRD4O60885 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRD4O60885 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRD4O60885 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRD4O60885 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRD4O60885 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
BRD4O60885 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRD4O60885 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRD4O60885 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRD4O60885 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
BRD4O60885 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRD4O60885 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRD4O60885 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRD4O60885 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRD4O60885 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRD4O60885 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRD4O60885 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD4O60885 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD4O60885 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD4O60885 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD4O60885 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD4O60885 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD4O60885 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD4O60885 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD4O60885 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD4O60885 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD4O60885 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD4O60885 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRD4O60885 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRD4O60885 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRD4O60885 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRD4O60885 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRD4O60885 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRD4O60885 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRD4O60885 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRD4O60885 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms