Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNG3O60359 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.1 ms