Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3APO60318 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCM3APO60318 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms