Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms