Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLIN1O60240 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms