Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3LO60238 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms