Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX16O60231 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX16O60231 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX16O60231 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX16O60231 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX16O60231 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX16O60231 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX16O60231 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX16O60231 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX16O60231 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX16O60231 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX16O60231 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX16O60231 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX16O60231 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DHX16O60231 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DHX16O60231 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX16O60231 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX16O60231 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX16O60231 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX16O60231 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX16O60231 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX16O60231 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX16O60231 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX16O60231 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX16O60231 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX16O60231 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX16O60231 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX16O60231 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX16O60231 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX16O60231 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX16O60231 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX16O60231 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX16O60231 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX16O60231 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX16O60231 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX16O60231 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX16O60231 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX16O60231 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX16O60231 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX16O60231 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX16O60231 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX16O60231 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX16O60231 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX16O60231 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX16O60231 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX16O60231 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX16O60231 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms