Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCO2O43819 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCO2O43819 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCO2O43819 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCO2O43819 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCO2O43819 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCO2O43819 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCO2O43819 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCO2O43819 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCO2O43819 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCO2O43819 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCO2O43819 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCO2O43819 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCO2O43819 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCO2O43819 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCO2O43819 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCO2O43819 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SCO2O43819 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms