Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP9O43818 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP9O43818 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP9O43818 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP9O43818 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP9O43818 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP9O43818 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP9O43818 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP9O43818 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP9O43818 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP9O43818 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP9O43818 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP9O43818 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP9O43818 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP9O43818 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP9O43818 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP9O43818 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP9O43818 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP9O43818 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP9O43818 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP9O43818 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP9O43818 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP9O43818 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP9O43818 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP9O43818 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP9O43818 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP9O43818 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP9O43818 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP9O43818 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP9O43818 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP9O43818 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP9O43818 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP9O43818 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP9O43818 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP9O43818 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP9O43818 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP9O43818 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP9O43818 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP9O43818 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP9O43818 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP9O43818 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP9O43818 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP9O43818 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP9O43818 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP9O43818 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP9O43818 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP9O43818 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRP9O43818 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRP9O43818 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRP9O43818 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRP9O43818 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRP9O43818 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms